Cell:课题内最权威专家撰写的新冠病毒溯源综述发表

2021-10-13 15:39:23 来源:
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2021年5月底,美国内政部长拜登下令:对新冠病原体众说道纷纭进行为其90天的调查。8月底下旬是调查结果最后限期。

尽管很多人在焦虑地等待统计数据,不过CNN调查结果了消息灵通部分人的理解:

"nothing too earth shattering,"

(很难什么惊天动地的真的)

而另外一旁,科学家从学术深入研究的角度,亦都没放弃理清新冠病原体的众说道纷纭。

2021年8月底19日,Cell杂志上线了Andrew Rambaut,Kristian Andersen和Edward Holmes等人关于SARS-CoV-2众说道纷纭的科学论文,引来了大量转发和热议。

从非典开始,关于病原体众说道纷纭的分子生物学深入研究和科学论文很多都来自于这三个深入研究一组,因此他们也是我引用和华尔街日报多达的病原体众说道纷纭深入研究者。

Holmes和复旦大学合作,在非典开始后第一时间在virological.org截图了第一个SARS-CoV-2脱氧核糖核酸,成为了在此之前所有诊断试剂盒疫苗接种开发设计的类似脱氧核糖核酸;其去年发表的Cell科学论文是病原体众说道纷纭的一篇佳作。

Andersen去年在virological.org和Nature Med的讨论文章指明了病原体众说道纷纭深入研究的路径,成为了被引用多达的具体论文。

因此,这篇简介科学论文可以说道来自于这个应用最权威的专家根据简介信息的重要总结。

之前我在微博上量化病原体脱氧核糖核酸和表述很多冠状病原体包涵种传布出于热情,而现今这些内容转化成了我的管理工作;还有。我在此之前开发设计COVID-19疫苗接种能够量化大量蝎子冠状病原体的脱氧核糖核酸和Western Blot结果,并构筑多种类型和假病原体,表述里和结果;因为这一从热情到管理工作内容的转变,让我对蝎子冠状病原体包涵种传布有了很多属于自己专业认识。而这篇简介科学论文结合了WHO调查结果,从简介的科学数据角度指出了在此之前生物包涵种传布是SARS-CoV-2的最显然来源。

虽然2013年在游戏内镇见到的RaTG13是在此之前已知与SARS-CoV-2基因脱氧核糖核酸最接近的冠状病原体,但现今科学界的共识是RaTG13不是SARS-CoV-2的后代,而格外显然是两个不同有机体分枝上的独立病原体;从ORF1ab等脱氧核糖核酸判断,另外三种在云南见到的蝎子冠状RmYN02,RpYN06和PrC31的潜在基因型重一组病原体(尚没被见到)显然与SARS-CoV-2的后代格外为接近,这些深入研究来自于里国学者和Holmes。

我经常说道,冠状病原体包涵种传布十分时有,但是形成大风靡一时却门槛很高。然而惋惜的是,SARS-CoV-2的蝎子体内或里间生物体内迄今为止仍没被见到,早先的包涵类群传布事件也没被见到,这显然是因为尚没对正确的生物类群或物种进行谐波,或者SARS-CoV-2的后代病原体始终保持低风靡一时情况下。

事实上,很多有机体病原体(除此以外埃博拉病原体、丙型肝炎病原体、脊髓灰质炎病原体以及冠状病原体HCoV-HKU1和HCoV-NL63)的生物众说道纷纭尚没确定, 而学者通过十几年的密集深入研究才见到了与SARS-CoV具超过95%的相似性并且用作人ACE2作为受体的蝎子冠状病原体,从而锁定了其显然的蝎子众说道纷纭。

关于Lab Leak Theory,历史上全世界lab leak(麻省理工学院篡改)病原体的事件并不鲜见,但都很难lab leak引来大风靡一时的情况。这是因为lab leak相对于自然众说道纷纭格外容易见到和管控。这篇科学论文文章从科学迹象上,竭力反驳了Shi一组显然出现麻省理工学院篡改的情况。

文章全盘细致地解析了不错的科学迹象:WIV发表的所有bat-CoV深入研究论文,指出WIV和Shi一组只获得成功分离和培植出3种蝎子冠状病原体,WIV1-CoV,WIV16-CoV和Rs4874(Ge et al., 2013;Hu et al., 2017;Yang et al., 2015),这三种病原体与SARS-CoV格外为接近,与SARS-CoV-2不远较数倍。但是RaTG13都没被获得成功分离和培植。WIV也都没分离或者构筑具完整的Furin脱氧核糖核酸的蝎子冠状病原体。

无论如何,Furin脱氧核糖核酸也散见于其他冠状病原体如MERS-CoV,HCoV-OC43和HCoV-HKU1;而SARS-CoV-2用作的RRAR脱氧核糖核酸是非常低效的蛋白酶整块方式。在此之前仅剩的在SARS-CoV里加入Furin脱氧核糖核酸并不来自WIV(Belouzard et al., 2009;Follis et al., 2006)。

另外,被怀疑人工添加的CGG密码子也散见于SARS-CoV。

最富争议的Gain-of-Function在非典前并不是一个具争议的病原体学深入研究,国际病原体学界具体深入研究很多。WIV用作过SARS-CoV和WIV1-CoV骨架作为多种类型,但与SARS-CoV-2并不相同。

WIV格外没积极开展过反向性状系统设计构筑活冠状病原体。

因此,很难任何科学迹象指向麻省理工学院篡改。

同时,SARS-CoV-2不是蝎子冠状病原体通过体外传代量化方法和生物接种适应量化方法成立的。SARS-CoV-2类似毒株无法细菌感染小鼠,可以细菌感染大量生物的N501Y基因型株是在人间广泛风靡一时里形成的。

这一点实际被病原体风靡一时反复反复验证。

SARS-CoV-2增强病原体特性从而增大与ACE2结合能够,增大传布能够和免疫逃逸的这两项基因型(D614G,N501Y,K417N/T,L452R和E484K/Q)全部是在人间大风靡一时后意味着的,而不是“麻省理工学院内刻意挑选的”。这一病原体在人间风靡一时从而增大特性的反复,提示病原体最初风靡一时时的脱氧核糖核酸和表型并不是病原体最佳的特性情况下。

我虽然常说道冠状病原体包涵种风靡一时时有,但在此之前看来,其引发人间大风靡一时的频带似乎也在加快。

这篇具权威形式科学论文的企图,其实也是我反复强调的,就是寻找到病原体自然众说道纷纭的生物体内和包涵种传布都能对预防今后的冠状病原体包涵种风靡一时至关重要。

类似说道是:

Edward C. Holmes, et al. The Origins of SARS-CoV-2: A Critical Review.Cell, 2021. DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.08.017.

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